等一碗热粥喝下肚，赤井舒了口气，感觉自己活了过来，他举起碗：“再来一碗！”琴酒接过碗又给他盛了一碗，在对面坐下，看着他狼吞虎咽：“吃慢点，吃点菜，你那么长时间没有吃饭，不能吃太多。”赤井夹了点酱菜，合着粥吃下，虽然还不满足，但他不敢在吃了。
琴酒双手交叉放在桌上：“黑衣组织毁灭了吗？”
赤井点点头：“虽然还有些余党在逃亡，但不成气候。”如此庞大的组织，牵连到的人不知有多少，本来就不可能全都抓到的，有些人说不定都没有办法再追踪到了，但这个庞大的地下王国解体已经是不可逆转的结局。压在他心上多年的阴影终于能够搬开了，世界上却减少很多罪恶。
琴酒有幻想过这一天，他觉得自己会松口气，也可能会有些怅然若失，然而真的到了这天他却发现自己并没有什么感觉，好像那些事情已经远离他很久了。
“那你要回美国了吗？”
“这里的事收尾之后就要回去，黑衣组织在美国也有势力，我们需要处理，日本就交给公安吧。”赤井想起安室对他凶神恶煞的态度，不就是把人绑起来了嘛，之前他不是还救过他一次吗？这是个小心眼的男人！“你要和我一起走吗？在美国可以结婚哦。”
“我在日本住惯了。”琴酒的意思是拒绝了，他生活在日本的时间比美国多多了，并不想去一个陌生的地方重新开始。以前奔波的太多，现在他十分懒，不想想太多、做太多。
赤井倒也不生气，虽然他拿到了美国的绿卡，但回日本也不是不能接受。秀吉本来就一直待在日本，现在玛丽妈妈和世良也回了日本。当年他为了追查父亲的死叛逆地违背妈妈的意愿，但不意味着他不想要全家团聚，等FBI的工作处理好了，他就辞职回日本。“那也行，那我们以后还住在米花町好了。”随后他开始计划未来的生活，连窗帘要用什么颜色的都想要了。
几天之后赤井返回美国，为了不当电灯泡而外出访友的大天狗和妖狐回来了，他们决定要返回原来生活的森林去。当初妖狐会来琴酒家是因为受伤，现在他不仅伤好了，还胖了不少，虽然很喜欢人类社会的东西，但长久地住下去不是个办法。妖狐摇晃着尾巴，尽量保持着轻松的笑容：“不用舍不得我啦，我会经常来找你玩的，毕竟在森林里都没有办法玩游戏。”
琴酒觉得他大概更看重游戏多一点，没好气地把他赶走了，妖狐走之前把他的土司软垫带上了。以前还不觉得，但两个妖怪离开后，面对只有自己一个人的房子，突然心里出现一种空落落的感觉，让他很不舒服。以前他独来独往，刀口舔血，从来没觉得孤单无助，果然人是不能惯的，懦弱的习惯总是很容易养成。
黑衣组织毁灭后，柯南回归到小学生的生活中，而灰原能够专心致志地研究解药，不需要再担心那天被黑衣组织抓住。不过关于药物的这件事，他们没有告诉公安，说白了是灰原不信任公安，所以即使失去官方能给的研究条件，她也选择独自研制。公安是国家的看门犬，为了完成目的，不择手段的事情多了，比如在他们面前出现次数比较多的安室也没有表面上那样温和，她不敢保证公安得到了这种药之后不会想要用来干点什么。即使过安稳生活很久了，她真正信任的人除了自己就只有柯南。
柯南虽然心急恢复身份，却无法说服灰原，而且他也不能辩驳灰原的说法。之前安室为了利用他的智慧去破案，故意将爆炸案栽赃到毛利小五郎头上，虽然安室做好了给毛利小五郎脱罪的准备，但柯南仍然无法认同他。这件事也导致柯南原来和安室不错的关系形成了裂痕。柯南信奉真相只有一个，从中能够体现出他的一种执拗——违法永远是违法，不管出于什么目的。从这点上，他和安室永远不会成为知己。
由于无法马上变回大人，柯南只能继续上小学，和少年侦探团一起玩，不过死神光环笼罩，他的生活中总少不了案子，倒也不平淡。服部还在追求他，被拒绝了几次都不气馁。柯南十分无奈：“我要是变不回去怎么办？”
“那我等你长大好了，再过十年我快三十岁，作为男人还很年轻，完全不要紧。等我大学毕业了，就开一家侦探事务所，以后你也加入，我们双剑合璧，绝对能成为最厉害的侦探组合的！”服部以前是有想过和父亲一样当警察的，但现在想想还是继续当侦探好，到时候他和新一工作上相辅相成，生活上互帮互助，简直完美！想想他都要被自己的美梦弄笑了。
柯南给了他一个大大的白眼：“你想太多了。”什么等他长大，搞得跟养成似的。十年太长，服部的条件不错，在学校里很有人气，说不定很快能遇到适合他的女孩。他不能浪费小兰的时间，也不能期望服部在他身上花那么多时间，或许有一天他会习惯自己现在的身份，不再有身体和年龄差异的变扭感，做一个普通的小孩，慢慢长大，然后遇上和他身体年龄一样的、适合他的女孩，过属于柯南的一辈子。要维持一个已经不在的身份是很难的，现在他很想变回新一，但等新一这个身份缺失太长时间，或许便不适合再出现，即使有了解药他也不会使用了。